Сегодня в основные функции сотрудников отдела специального учета входит: точное и безусловное исполнение приговоров, постановлений и определений судов в отношении осужденных и лиц, содержащихся под стражей; направление осужденных к лишению свободы к месту отбывания наказания, их размещение, а также перевод осужденных и лиц, содержащихся под стражей, из одних учреждений исполняющих наказания, и следственных изоляторов в другие; рассмотрение письменных обращений граждан, заявлений и жалоб осужденных и лиц, содержащихся под стражей.